Осы Келісімді іске асыру мақсатында Тараптар мынадай уәкілетті органдарды тағайындайды: Қазақстан тарабынан - Қазақстан Республикасы Қорғаныс министрлігі; Тәжікстан тарабынан - Тәжікстан Республикасы Қорғаныс министрлігі. Уәкілетті органдардың атауы немесе функциялары өзгерген кезде Тараптар дипломатиялық арналар арқылы бір-бірін дереу хабардар етеді.