Шекаралық ынтымақтастық мынадай қағидаттарға негізделеді: Тараптардың егемендігін, аумақтық тұтастығын өзара құрмет тұту; мемлекеттік шекараға қолсүғылмаушылық; Тараптардың ұлттық заңнамасын өзара құрмет тұту; азаматтардың денсаулығына және қоршаған ортаға зиян келтірмеу, Тараптардың экономикалық және өзге де мүдделеріне нұқсан келтірмеу; Тараптардың өзара пайдасы; шекаралық дауларды бейбіт жолмен шешу; осы Конвенцияға қатысушылар болып табылмайтын ТМД-ға қатысушы басқа да мемлекеттердің ішкі істеріне араласпау; ТМД-ға қатысушы мемлекеттер азаматтарының құқықтары мен бостандықтарын құрмет тұту; шекаралық ынтымақтастыққа қатысушылар іс-қимылының үйлесімділігі.