Шекаралық аумақты дамыту мақсатында Тараптар қызметтің мынадай бағыттарын дамытуға ықпал етеді: шекаралық аумақтарда ерекше немесе арнайы экономикалық аймақтар (еркін экономикалық аймақтар) құру; шекаралық сауда-саттық, оның қауіпсіздігін қамтамасыз ету; құзыретті органдардың трансшекаралық өзендерді қоса алғанда, қоршаған орта мониторингі және оны қорғау жөнінде және табиғи ресурстарды ұтымды пайдалану, халықтың санитарлық-эпидемиологиялық, экологиялық, ветеринариялық-санитарлық салауаттылығын, сондай-ақ жануарлардың жұқпалы ауруларын енгізуден аумақтарды қорғау жөнінде бірлескен іс-шаралар жүргізу; табиғи және техногендік сипаттағы төтенше жағдайлардан халықты және аумақты қорғау жөнінде бірлескен бағдарламарлар әзірлеу, сондай-ақ трансшекаралық салдары бар төтенше жағдайларға ден қоюдың тиімділігін арттыру мақсатында шекаралық аумақтардағы табиғи және техногендік сипаттағы төтенше жағдайлардың алдын алу мен оларды жою жүйелерін интеграциялау; Тараптардың шекаралық аудандарда тұратын отандастарға, сондай-ақ гуманитарлық байланыстарды сақтауға және кеңейтуге қолдау көрсетуі; Тараптардың мемлекеттік шекараларын күзету мен қорғаудың тиімділігін арттыру жөніндегі күш-жігерлерді келісу; инвестициялық жобаларды жүзеге асыру; өндірістік-техникалық ынтымақтастық; ауыл шаруашылығы және азық-түлікпен қамтамасыз ету; көлік; ақпараттық технология және байланыс; құқық қорғау қызметі; қала құрылысы және коммуналдық шаруашылық; халықтың көші-қонын реттеу; еңбек нарығын қалыптастыру; денсаулық сақтау; білім беру; ғылыми және гуманитарлық ынтымақтастық; мәдениет және спорт; туризм; шектес мемлекеттердің шекаралық өкілдерімен шекара өкілдігі қызметін жүзеге асыру; көрмелік және жәрмеңкелік қызмет. Тараптар шекаралық ынтымақтастықтың өзге де бағыттары бойынша шекаралық ынтымақтастықты жүзеге асыра алады.