Магистральдық құбыр саласындағы қызметтің негізгі қағидаттары мыналар болып табылады:
1) өнімді тұтынушыларға тасымалдау кезінде адам мен мемлекет қауіпсіздігінің, қоршаған ортаны қорғаудың басымдығы;
2) магистральдық құбыр саласындағы қатынастардың барлық субъектілерінің мүдделерін сақтау және магистральдық құбырға кемсітусіз қолжетімділікті қамтамасыз ету;
3) магистральдық құбырды жобалау, салу, пайдалану, реконструкциялау және жою кезінде тиімді әдістер мен технологияларды пайдалану;
4) магистральдық құбыр мен оның объектілерін салу, олардың жұмыс істеуі, оларды реконструкциялау, күрделі жөндеу және жою кезінде қоршаған ортаға, азаматтардың өмірі мен денсаулығына, олардың мүлкіне, сондай-ақ заңды тұлғалардың мүлкіне келтірілген зиянды толық өтеудің міндеттілігі;
5) Қазақстан Республикасының энергетикалық қауіпсіздігінің басымдығы.