Осы Келісімді іске асыру мақсатында Тараптар мынадай уәкілетті органдарды тағайындайды: Қазақстан тарапынан - Қазақстан Республикасы Қорғаныс министрлігі; Тәжікстан тарапынан - Тәжікстан Республикасы Қорғаныс министрлігі. Уәкілетті органдардың атауы немесе функциялары өзгерген кезде Тараптар бірін-бірі дипломатиялық арналар арқылы дереу хабардар етеді.