Санитариялық-эпидемиологиялық аудит рәсімі бірнеше кезеңнен тұрады және мыналарды:
- 1) санитариялық-эпидемиологиялық аудит жүргізу туралы өтінішті тіркеуді;
- 2) өтініш беруші табыс еткен құжаттарды алдын ала талдауды;
- 3) санитариялық-эпидемиологиялық аудит жүргізуге шарт жасасуды;
- 4) санитариялық-эпидемиологиялық аудиттің мақсаттарын белгілеуді;
- 5) санитариялық-эпидемиологиялық аудит жүргізу жоспарын жасауды;
- 6) санитариялық-эпидемиологиялық аудит жүргізуді (объектіні тексеру, материалдарды талдамалық өңдеу, салыстырмалы талдау және жоспарланып отырған не жүзеге асырылып жатқан қызметтің санитариялық-эпидемиологиялық қауіптілік дәрежесіне, объектіні іске асыру негіздемелерінің жеткіліктілігі мен анықтығына бағалау жүргізу);
- 7) аудиторлық есепті жасауды және оны өтініш берушіге табыс етуді қамтиды.