Аквашаруашылықты субсидиялау мынадай бағыттар бойынша жүзеге асырылады:
- 1) аквашаруашылық өнімінің өнімділігі мен сапасын арттыру, сондай-ақ асыл тұқымды балық өсіруді дамыту;
- 2) аквашаруашылық саласында инвестициялық салымдар болған кезде шығыстардың бір бөлігін өтеу;
- 3) аквашаруашылық саласында су беру бойынша көрсетілетін қызметтер құнын субсидиялау;
- 4) аквашаруашылық саласында техника мен технологиялық жабдық сатып алуға кредит беру, сондай-ақ лизинг кезінде сыйақы мөлшерлемелерін субсидиялау;
- 5) субсидиялаудың Қазақстан Республикасының заңдарында көзделген өзге де бағыттары.