Қор қаражатының нысаналы пайдалануын бақылауды Үйлестіру кеңесі, Қазақстан Республикасы Жоғарғы Кеңесінің Бақылау Палатасы, Қазақстан Республикасы Министрлер Кабинеті жанындағы Мемлекеттік қаржы бақылау комитеті жүзеге асырады.