Санитарно-карантинным контролем является контроль за санитарно-эпидемиологическим состоянием товаров (грузов) и состоянием здоровья людей при перемещении людей и товаров (грузов) через таможенную границу Евразийского экономического союза, проводимый в целях недопущения завоза на таможенную территорию Евразийского экономического союза инфекционных и паразитарных заболеваний, а также потенциально опасных для здоровья человека веществ и продукции.Санитарно-карантинный контроль в автомобильных пунктах пропуска через таможенную границу Евразийского экономического союза осуществляется должностными лицами таможенных органов в порядке, определенном совместным актом уполномоченного органа и государственного органа в сфере санитарно-эпидемиологического благополучия населения.
В случае возникновения реальной угрозы завоза инфекционных и паразитарных заболеваний, а также потенциально опасных для здоровья человека веществ и продукции из других государств, не являющихся членами Евразийского экономического союза, таможенные органы в целях проведения санитарно-карантинного контроля привлекают территориальные органы в сфере санитарно-эпидемиологического благополучия населения в порядке, определенном совместным актом уполномоченного органа и государственного органа в сфере санитарно-эпидемиологического благополучия населения.