Министерство науки и высшего образования Республики Казахстан имеет ведомства:
- 1) Комитет высшего и послевузовского образования Министерства науки и высшего образования Республики Казахстан;
- 2) Комитет по обеспечению качества в сфере науки и высшего образования Министерства науки и высшего образования Республики Казахстан;
- 3) Комитет науки Министерства науки и высшего образования Республики Казахстан;
- 4) Комитет языковой политики Министерства науки и высшего образования Республики Казахстан.