Область Абай и Восточно-Казахстанская область богаты водными ресурсами, здесь протекает более 800 рек, общая протяженность которых составляет свыше 10 тысяч километров. Протяженность реки Ертис по территории Республики Казахстан - 1 700 километров, в том числе по территории областей - 1 311 километров. В области Абай и Восточно-Казахстанской области самыми крупными водохранилищами являются Шульбинское и Бухтарминское. Функционируют Усть-Каменогорский, Бухтарминский и Шульбинский шлюзы.