1. При оценке численности редких и находящихся под угрозой исчезновения видов рыб, если они обитают в мелководных нешироких водоемах с прозрачной водой, применятся визуальный подсчет проходящих производителей и определение численности с использованием фото– и видеосъемки (прижизненный метод).
2. При проведении исследований совместно с зарубежными учеными на трансграничных водоемах, используются методики, предусмотренные международными договорами.
3. В отдельных случаях, на водоемах и (или) участках специального назначения, например, в охраняемой зоне верхнего и нижнего бьефов гидроэлектростанции (ГЭС), возможно использование иных методик исследований, с обоснованием их выбора в биологическом обосновании.
4. Определение количества и места расположения станций по отбору проб на водоемах проводится согласно методическим рекомендациям по сбору и обработке материалов при гидробиологических исследованиях. Координаты станций определяются с помощью навигационной системы GPS или ГЛОНАСС.