1. Авиаучет производятся над акваторией, прилегающей к побережью Каспийского моря.
2. Весенний авиаучет проводится в период с марта по апрель для учета максимальной численности тюленей во время линьки.
3. Осенний авиаучет проводится в период с октября по ноябрь для учета численности предзимних скоплений тюленей.
4. Перед проведением авиаучета производится анализ космических снимков по данным дистанционного зондирования различных спутниковых систем для оценки расположения островов и шалыг (возвышения на дне моря) на мелководье и гидрометеорологических условий для оценки благоприятной погоды для полетов. Разрабатывается маршрут полета.
5. Авиаучеты производятся с борта самолета, вертолета с высоты от 200 до 300 метров, скорость воздушного судна не должна превышать 300 километров/час. В авиаучете участвуют 5 специалистов. Используются фотоаппараты и видеокамеры с высоким разрешением. До полетов у всех специалистов производится сверка установленного времени на фото-видеотехнике, диктофонах, GPS навигаторах и синхронизация времени указанных устройств с разницей до 1 секунды для того, чтобы при обработке фото-видеоматериала была точная их привязка к точкам маршрутов полетов.
6. Маршрут авиаучета должен охватывать все потенциальные лежбища каспийского тюленя, в процессе полета операторами ведется непрерывная видеосъемка, фотографирование обнаруженных залежек и встречающихся тюленей на акватории. В отдельных случаях производится визуальный подсчет и запись на диктофон. Данные о времени взятия каждого фото-, видеоматериала и скриншотов определяются из метаданных.
7. В лабораторных условиях все фото- и видеоснимки просматриваются на наличие тюленей, при этом видео останавливается каждую секунду, при наличии тюленей скриншоты сохраняются. В соответствующих графических редакторах на фотографиях и скриншотах производится подсчет и нумерация изображений тюленей. Производится прослушивание записи диктофона на возможность определения мест обнаружения тюленей, которые не попали на видео, и также записываются данные о голосовом подтверждении наличия тюленей и их количестве в таблицу. Голосовые сообщения, не подтвержденные фото-видеокадрами, относятся к экспертному заключению. Определение координат для каждого кадра и встреч тюленей происходит с помощью записей полета на GPS-устройства.
8. Производится подсчет количества тюленей по каждой залежке и точке обнаружения тюленей, сумма которых определяет общее количество залегающих тюленей в казахстанском секторе Каспийского моря.
9. При неблагоприятных погодных условиях и снижении ввиду этого качества фото-видеоматериалов (соляная буря, туман и др.) оценка численности животных на лежбищах проводится путем экстраполяции, рассчитанной средней плотности залегающих зверей на определенных участках на всю площадь залежки на лежбище.