Задачи медицинских подразделений управления определяются условиями учебно-боевой подготовки и быта войск, состоянием здоровья, физическим развитием, уровнем и характером заболеваемости военнослужащих, санитарно-эпидемиологическим состоянием и климатогеографическими условиями районов дислокации войск.