Патологоанатомическая диагностика в военно-медицинских учреждениях проводится с целью установления диагноза путем анализа совокупности изменений в органах (фрагментах органов), тканях и клетках пациентов, изъятых путем хирургической операции и (или) биопсии (операционно-биопсийного материала), а также в тканях, органах и клетках трупа в ходе патологоанатомического вскрытия в соответствии с приказом Министра здравоохранения Республики Казахстан от 14 декабря 2020 года № ҚР ДСМ - 259/2020 "Об утверждении стандарта организации оказания патологоанатомической диагностики в Республике Казахстан" (зарегистрирован в Реестре государственной регистрации нормативных правовых актов под № 21790). При отсутствии возможности проведения патологоанатомической диагностики, военно-медицинские учреждения заключают гражданско-правовой договор с организациями здравоохранения, оказывающими услуги патологоанатомической диагностики.