Профилактическая дезинфекция проводится систематически независимо от эпидемической обстановки. Профилактической дезинфекции подвергаются уборные, помойные ямы, мусоросборники, бани (санитарные пропускники), караульные помещения, казармы, столовые, помещения медицинских подразделений и учреждений, питьевая вода, канализационные стоки, продовольственные склады, транспорт и другие объекты, накопление патогенных возбудителей в которых представляет угрозу для личного состава. Она проводится дезинфектором, в том числе внештатным, с привлечением личного состава подразделений и лиц суточного наряда. Лица, привлекаемые к проведению дезинфекционных мероприятий, ежегодно проходят инструктаж по вопросам безопасного осуществления работ, оказания первой помощи при отравлении дезинфицирующими средствами.