Деятельность следственного управления ДП организуется по предметно-зональному принципу во взаимодействии с другими службами ДП и соответствующими правоохранительными, контролирующими ведомствами, основанном на уголовно-процессуальном законодательстве, ведомственных нормативных актах, на принципах координации усилий в борьбе с преступностью.