Непосредственное руководство вузом осуществляет начальник вуза, назначаемый на должность и освобождаемый от должности приказом Министра внутренних дел Республики Казахстан (далее - Министр). Заместители начальника вуза назначаются и освобождаются от должности приказом Министра по представлению начальника вуза (в военных вузах - заместители начальника назначаются и освобождаются от должности приказом заместителя Министра - Главнокомандующего Национальной гвардией Республики Казахстан).