Финансирование деятельности Антитеррористического центра производится за счет и в пределах средств, предусмотренных в республиканском бюджете на соответствующий финансовый год Комитету национальной безопасности Республики Казахстан, а также государственным органам, входящим в состав Антитеррористического центра.