Задачей Комиссии является осуществление на постоянной основе мониторинга за целевым, законным и эффективным использованием средств, выделенных из Национального фонда Республики Казахстан, в том числе посредством проведения мониторинга реализации и аудита финансовой части критически важных объектов, проектов общестранового значения и иных проектов, финансируемых за счет средств Национального фонда Республики Казахстан (далее - Национальный фонд), в том числе путем облигационного заимствования.