Основными задачами государственного управления в области использования и охраны водного фонда, водоснабжения и водоотведения являются:
1) анализ и оценка водообеспечения отраслей экономики, состояния водоснабжения и водоотведения населенных пунктов, выявление недостатков и определение мер по их устранению;
2) определение располагаемых объемов водных ресурсов, их качества и наличия прав пользования ими;
3) разработка основных направлений совершенствования технологий в области водоснабжения, водоотведения и охраны вод, в том числе в целях адаптации к изменению климата;
4) прогноз и организация мероприятий по увеличению объемов располагаемых водных ресурсов и рациональному перераспределению их для покрытия дефицита воды;
5) установление структуры водопользования с распределением водных ресурсов по приоритетности удовлетворения потребности в воде в зависимости от водности года;
6) лимитирование водопользования и сброса возвратных вод на основе научно обоснованных нормативов;
7) планирование и соблюдение экологических требований;
8) контроль за количественным и качественным состояниями водных объектов и режимом использования вод;
9) эффективное управление водными объектами и водохозяйственными сооружениями, находящимися в государственной собственности;
10) развитие рынка водохозяйственных услуг;
11) совместное с сопредельными государствами управление в области использования и охраны трансграничных вод;
13) обеспечение безопасности водохозяйственных систем и сооружений;
14) контроль за состоянием водохозяйственных систем и сооружений, а также за их соответствием требованиям законодательства Республики Казахстан;
15) обеспечение баланса интересов участников правоотношений в области водоснабжения и водоотведения;
16) сбалансированность прав, обязанностей и интересов водопотребителей и организаций по водоснабжению и (или) водоотведению;
17) создание условий для внедрения и приоритетного развития энергосберегающих и водосберегающих технологий;
18) государственная поддержка реконструкции и развития систем водоснабжения и водоотведения, проведения научных исследований, проектирования в области водоснабжения и водоотведения.