Основными функциями системы обеспечения национальной безопасности являются:
1) определение национальных интересов Республики Казахстан;
2) определение целей, задач и основных направлений обеспечения национальной безопасности;
3) выявление, анализ, оценка и прогнозирование угроз национальной безопасности;
4) разработка и осуществление комплекса оперативных и долговременных мер по предупреждению и нейтрализации угроз национальной безопасности;
5) продвижение политических инициатив, направленных на укрепление международной безопасности;
6) содержание в постоянной готовности сил обеспечения национальной безопасности;
7) участие в обеспечении международной (глобальной, региональной) безопасности в соответствии с международными договорами, ратифицированными Республикой Казахстан.